Bioinformatik

Ein Leitfaden für Naturwissenschaftler
2., überarbeitete und erweiterte Auflage 2004
ISBN: 978-3-7643-6253-9
Verlag: Springer

Buch, Deutsch, 156 Seiten, Paperback, Format (B × H): 178 mm x 254 mm, Gewicht: 322 g

Locker und leicht verständlich geschrieben führt dieser Leitfaden in die Grundlagen und Möglichkeiten der Sequenzanalyse ein.

Das Buch beginnt mit einer Einführung in die wichtigen Sequenzdatendatenbanken am NCBI und EMBL sowie in die wachsende Zahl der Motivdatenbanken. Anschließend werden die einfachsten Methoden des paarweisen Sequenzvergleiches in globalen und lokalen Alignments beschrieben sowie die gängigsten heuristischen Verfahren der Datenbanksuche (FASTA und BLAST). Multiple Alignments, Substitutionsmatrizen und die Berechnung phylogenetischer Bäume werden dem Leser nahe gebracht. Neu hinzugekommen sind auch Erläuterungen der Prinzipien der Genomanalyse und der gängigsten Algorithmen zur Genvorhersage. Zu jeder Methode werden Online-Tools im Internet oder freie Software angegeben.

Das Buch richtet sich an Anwender und Einsteiger in die Bioinformatik, speziell Studenten und Forscher, die sich mit der Sequenzanalyse auseinandersetzen müssen.

Zielgruppe

Research

Autoren/Hrsg.

Hansen, Andrea

Fachgebiete

• Technische Wissenschaften Verfahrenstechnik | Chemieingenieurwesen | Biotechnologie Biotechnologie Industrielle Biotechnologie
• Mathematik | Informatik Mathematik Numerik und Wissenschaftliches Rechnen Angewandte Mathematik, Mathematische Modelle
• Naturwissenschaften Biowissenschaften Angewandte Biologie Bioinformatik
• Naturwissenschaften Biowissenschaften Molekularbiologie
• Naturwissenschaften Biowissenschaften Biochemie (nichtmedizinisch)
• Naturwissenschaften Biowissenschaften Zellbiologie
• Mathematik | Informatik EDV | Informatik Angewandte Informatik Bioinformatik

Inhaltsverzeichnis

1 Einstieg in die Sequenzanalyse.- 2 Primäre Datenbanken.- 3 Sequenzformate.- 4 Einfache Alignments.- 5 Heuristische Methoden zum Sequenzvergleich.- 6 Multiple Alignments.- 7 Phylogenetische Analysen.- 8 Abgeleitete Datenbanken.- 9 Primerdesign.- 10 Genomanalyse.- Weblinks.